bioinformatics生物信息学软件Geneious 中关于alignment比对的相关参数解释

Needleman-Wunsch，PAM250、BLOSUM62、BLOSUM90、BLOSUM30，CLUSTALW，在geneious的比对参数里面有很多这样那样的设置，那么，他们是什么含义，我们应该怎样设置呢？

以下是相关解释
Needleman-Wunsch算法：
是针对寻求最佳序列比对这一问题所设计的动态规划寻优策略（Needleman and Wunsch,1970）。动态规划的思想是这样的，如果一条路径终止于最佳路径上的一点，那么这条路径本身就是起点到这个中间点的最佳路径，也就是说，任何一个终止于最佳路径上的一点的次级路径必然就是终止于这一点的最佳路径本身。这样，最佳路径就可以通过把各个最佳的次级路径连接而成。在基本的Needleman-Wunsch公式表达中，最佳比对必然对每个序列都由始至终，就是说从搜索空间的左上角直至右下角。换句话说,它搜索全程比对。
然而，对这种基本策略稍作修改就可以实现最佳的局部比对。这种比对的路径不需要到达搜索图的尽头，只需要在内部开始和终结。如果某种比对的打分值不会因为增加或减少比对队的数量而增加时，这种比对就是最佳的。这个过程依赖于打分系统的性质，就是说某种路径的打分会在不匹配的序列段位置减少（以下叙述的打分系统合乎这个标准）。当分值降为零时，路径的延展将会终止，一个新的路径就会应运而生。这样，我们会得到许多独立的路径，它们以不匹配的序列段为界限而不是像在全程比对中以序列的结尾作为界限。在这些路径中，拥有最高分的一个就是最佳的局部比对。
应该意识到，寻优方法总是把最佳的比对方法表达出来，而不在意它是否具有生物学意义，另一方面，寻求局部比对时可能会发现若干个重要的比对，因此，不能仅仅注意最佳的一个。改良的Smith-Waterman(Altschul and Erickson,1986;Waterman and Eggert,1987)算法把寻找K种最好的但不相互交叉的比对方式最为目标，这些思想后来都在SIM算法(Huang et al.,1990)的发展中得以体现。一个名叫LALIGN（在FASTA程序包中）的程序提供了有用的SIM工具(Pearson,1996)。对于比对多模块的蛋白质而言，寻找次优比对尤为重要。

PAM和BLOSUM
在进行序列两两比对时，有两方面问题直接影响相似性分值：取代矩阵和空位罚分。粗糙的比对方法仅仅用相同/不同来描述两个残基的关系，显然这种方法无法描述残基取代对结构和功能的不同影响效果，缬氨酸对异亮氨酸的取代与谷氨酸对异亮氨酸的取代应该给予不同的打分。因此如果用一个取代矩阵来描述氨基酸残基两两取代的分值会大大提高比对的敏感性和生物学意义。虽然针对不同的研究目标和对象应该构建适宜的取代矩阵，但国际上常用的取代矩阵有PAM和BLOSUM等，它们来源于不同的构建方法和不同的参数选择，包括PAM250、BLOSUM62、BLOSUM90、BLOSUM30等。对于不同的对象可以采用不同的取代矩阵以获得更多信息，例如对同源性较高的序列可以采用BLOSUM90矩阵，而对同源性较低的序列可采用BLOSUM30矩阵

详细的说，在比较蛋白质时，我们可以用取代矩阵来增强弱势比对的敏感性。很显然，在相关蛋白质之间，某些氨基酸可以很容易地相互取代而不用改变它们的生理生化性质，这些保守取代的例子包括异亮氨酸（isoleucine）和颉氨酸（valin）（体积小，疏水），丝氨酸（serine）和苏氨酸（threonin）（极性）。在计算比对分之时，相同的氨基酸打分会高于取代的氨基酸，而保守的取代打分高于非保守变化，换句话说，设计了一系列的分值，而且，在比对非常相近的序列（mouse和rat的同源基因）以及差异极大的序列（mouse和 yeast的基因）时会设计出不同系统的分值，考虑到这些因素，使用取代矩阵会极为有利，在这个矩阵中，任何氨基酸配对的分值会一目了然。
第一个广泛使用的最优矩阵建立在进化的点突变模型上（PAM）（Dayhoff et al.,1978）。一个PAM就是一个进化的变异单位即1%的氨基酸改变，这并不意味着经过100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次改变，甚至可能变回到原先的氨基酸，因此另外一些氨基酸可能不发生改变。如果这些变化是随机的，那么每一种可能的取代频率仅仅取决于不同氨基酸的出现的频率（称为背景频率）。然而，在相关蛋白中，已经发现的取代频率（称为目标频率）大大地倾向于那些不影响蛋白质功能的取代，换句话说，这些点突变已经被进化所接受。Dayhoff同合作者们第一次使用了log-odd处理，在这种处理中，矩阵中的取代分值同目标频率于背景频率的比值的自然对数成比例。为了评估目标频率，人们用非常相近的序列（比对时不需要取代矩阵）来收集对应于一个PAM的突变频率，然后将数据外推至250个PAM，PAM250矩阵结果如图7.7。虽然Dayhoff等人只发表了PAM250，但潜在的突变数据可以外推至其它PAM值，产生一组矩阵，在比较差异极大的序列时，通常在较高的PAM值处得到最佳结果，比如在PAM200到250之间，较低值的PAM矩阵一般使用于高度相似的序列（Altschul,1991）。

用同样方式建立了BLOSUM取代矩阵，但在评估目标频率时，应用了不同的策略，基本数据来源于BLOCKS数据库，其中包括了局部多重比对（包含较远的相关序列，同在PAM中使用较近的相关序列相反）。虽然在这种情况下，没有进化模型，但它的优点在于可以通过直接观察获得数据而不是通过外推获得。同PAM模型一样，也有许多编号的BLOSUM矩阵，这里的编号指的是序列可能相同的最高水平，并且同模型保持独立性。举例来说，如图7.8所示的BLOSUM的矩阵，至少有62%的相同比例的序列被组合成一个序列，因此取代频率更加受到那些比空位变化还大的序列的极大影响，取代矩阵在处理高度相似序列时使用高的阈值（直至BLOSUM90），处理差异大的序列时使用低的阈值（直至BLOSUM30）。


PAM和BLOSUM之间的区别

PAM矩阵根据一个明确演变模型(即 替换在一棵种系发生的树的分支计数)，而BLOSUM矩阵根据演变一个含蓄模型。
PAM矩阵根据变化被观察在全球性对准线中，这包括高度被保存的和高度可变的地区。 BLOSUM矩阵根据高度被保存的地区仅参加一系列禁止的对准线包含空白。
使用的方法计数替换是不同的： 不同于PAM矩阵， BLOSUM做法使用之内不是所有的变化计数同样的小组序列在。
而大数在BLOSUM矩阵命名计划表示更高的序列相似性并且更小的演变距离，高数量在PAM矩阵命名计划表示更大的演变距离。 例子： PAM150为更加遥远的序列比PAM100使用; BLOSUM62为更加接近的序列比Blosum50使用。
有观点认为，PAM模型可用于寻找蛋白质的进化起源，而BLOSUM模型用于发现蛋白质的保守域。


多序列比对的方法选择

顾名思义，多序列比对就是把两条以上可能有系统进化关系的序列进行比对的方法。目前对多序列比对的研究还在不断前进中，现有的大多数算法都基于渐进的比对的思想，在序列两两比对的基础上逐步优化多序列比对的结果。进行多序列比对后可以对比对结果进行进一步处理，例如构建序列模式的profile，将序列聚类构建分子进化树等等。

目前使用最广泛的多序列比对程序是CLUSTALW(它的PC版本是CLUSTALX)。CLUSTALW是一种渐进的比对方法，先将多个序列两两比对构建距离矩阵，反应序列之间两两关系；然后根据距离矩阵计算产生系统进化指导树，对关系密切的序列进行加权；然后从最紧密的两条序列开始，逐步引入临近的序列并不断重新构建比对，直到所有序列都被加入为止。

CLUSTALW的程序可以自由使用，在NCBI的FTP服务器上可以找到下载的软件包。CLUSTALW程序用选项单逐步指导用户进行操作，用户可根据需要选择打分矩阵、设置空位罚分等。EBI的主页还提供了基于Web的CLUSTALW服务，用户可以把序列和各种要求通过表单提交到服务器上，服务器把计算的结果用Email返回用户。

CLUSTALW对输入序列的格式比较灵活，可以是前面介绍过的FASTA格式，还可以是PIR、SWISS-PROT、GDE、Clustal、GCG/MSF、RSF等格式。输出格式也可以选择，有ALN、GCG、PHYLIP和GDE等，用户可以根据自己的需要选择合适的输出格式。

用CLUSTALW得到的多序列比对结果中，所有序列排列在一起，并以特定的符号代表各个位点上残基的保守性，“*”号表示保守性极高的残基位点；“.”号代表保守性略低的残基位点。

我认为，在多序列比对中，geneious的比对不如clustal严谨（也可能是我参数设置的问题）。寻找同源区域时没有显著差别，但是构建进化树时，强烈建议使用clustal作为比对工具。

用GappProxy搭建google个人代理（转载）

出于快速寻找国际信息的目的，一款好的代理会让我们工作免受网络速度影响，更有效率。 这是一款名为GAppProxy的代理服务器，与其他代理服务器相比，至少有三大优点。首先， GAppProxy是基本Google App Engine的，架设方便、长期存在，不用再隔天换代理IP了； 其次，冲着Google的名气，稳定有保证；最后，正因为Google服务器遍布全世界，所以 GAppProxy跑起来的速度相当快速。软件的介绍和下载地址见： http://code.google.com/p/gappproxy（上不去的用可用在线代理）  GAppProxy是一个完整的Proxy解决方案：与常见的HTTP Proxy不同，GAppProxy运行在 Google App Engine上， 不需要专门的服务器，只要一个客户端即可使用Google无限 的资源。GappProxy默认的是公用的代理服务器，用户多速度也一般。今天讲搭建Google  App Engine个人代理服务器的具体实现，主要是搭建个人的Proxy，自己管理和使用， 速度优于公共的Fetch Server，同时更不容易被封。下面将完整的介绍怎样搭建自己的 Fetch Server,以及如何使用的过程。主要是申请Google App Engine账户，上传 GAppProxy源代码，配置浏览器端代理，三大步！懂的，可以略过。  1.申请一个Google App Engine帐号，开启一个应用 到Google App Engine申请一个帐号，在右边填入自己的Google帐号，密码，即可以进入：  进到里面后点击下面的那个Create An Application按钮打开新页面： 在这个页面，你填入你的手机号码（前面加上+86）点击 Send你会收到一个字符串  输入字符串，你就成功申请到一个GoogleAppEngine的账 户啦！恭喜现在开始创建一个应用：  照上面的填入你自己想取的应用名称，点击Save就可以啦！ 出来下面的这个页面就说明你创建成功了一个应用。  回来，我们就会看见我们刚刚创建的那个应用已经出现啦！ 至此，我们这一步已经完成。现在转到GAppProxy源码包的 下载及其上传步骤！  2.下载GAppProxy源码包，上传至Google App Engine应用  GappProxy所需文件已上传到网络硬盘  原始下载  http://gappproxy.googlecode.com/files/fetchserver-1.0.0beta.tar.gz  http://gappproxy.googlecode.com/files/gappproxy-1.0.0beta.tar.gz  解压fechserver服务端源码包，里面东西如下： 这里我们打开FetchServer文件夹中的app.aml文件 (用文 本编辑器 不是记事本,用Ultra Edit ，notepad之类的)  修改第一行中application后面的名称，把 your_application_name改成你刚刚创建的应用名称，比如你 的AppEngine地址是aaa.appspot.com，那就是application帐 号就是aaa（记着冒号和用户名之间还有个空格，最好就是把 your_application_name这一项全选中，从开始的y选到结尾 的e一个字符也不差，然后修改成你的用户名，在英文输入法 状态下）保存这个文件，退出  上传方法一：（较简易）  我这里用的是一个Google App Engine的第三方上传工具 SDUpload ，下载地址：http://code.google.com/p/sdapp /downloads/list。这个东西不需要配置Python和Google App Engine SDK的运行环境，在Windows下直接运行。  上传命令：SDUpload update fetchserver-1.0.0beta  其中：SDUpload为程序名；update为更新或上传的命令； fetchserver-1.0.0beta是程序所在目录。  首先，先下载SDUpload程序，解压后，将 fetchserver-1.0.0beta文件夹拷贝放到SDUpload文件夹里面：  我们直接在window命令行（开始—运行—cmd)输入操作命令，进入SDUpload文件夹，然后 输入SDUpload update fetchserver-1.0.0beta 命令，按回车   下面会提示你输入Google邮箱帐号以及密码，照提示输入完以后点击回车 即开始上传。上传成功后再进入你的Google App Engine 账户查看是否上 传成功！（以防万一）  测试 fetchserver：打开浏览器， 进入 http://yourname.appspot.com/fetch.py  如果得到 “GAppProxy/1.2.0 beta 已经在工作了”证明安装成功。 这里的yourname是你的用户名。  上传方法二：  这个就是传统的上传，比较繁琐，但比较可靠，需要先下载Python2.5以上 以及Google App Engine SDK开发包。  Python 2.6.1下载 http://www.python.org/ftp/python/2.6.1/python-2.6.1.msi    Python 2.6.4下载 http://www.python.org/ftp/python/2.6.4/python-2.6.4.msi  Google App Engine SDK 1.3.0下载 http://googleappengine.googlecode.com/files/GoogleAppEngine_1.3.0.msi  Python以及Google App Engine SDK安装完成后，把前面下的fetchserver文件解 压到Google App Engine SDK安装目录里。点开始->运行输入cmd，调出DOS ， 进入刚刚安装好的Google App Engine SDK安装目录，输入： appcfg.py update fetchserver-1.0.0beta 然后会有提示你输入Google账户以 及密码（输入密码是CMD不会有任何反应），回车就上传了。  同样，上传后，再进入你的Google App Engine 账户查看是否上传成功！（ 以防万一）  3.设置浏览器，成功实现代理 解压上面下载的GAppProxy-1.0.0beta.exe文件安装（其实不算是安装，这个就 是一个自解压文件） 运行gui.exe，在Use Fetch Server里面填上你自己在GAE上架设了Fetch Server， 例如，你的AppEngine地址是aaa.appspot.com，那application帐号就是aaa， 则你应该在Use Fetch Server里面填上：http://aaa.appspot.com/fetch.py， 再勾选Use Fetch Server，点击Save，以及Quit保存设置重新启动GAppProxy 即可生效。    要是想直接注册为系统启动项，就打开GAppProxy里面的service文件夹， 双击install.bat文件，这样就可以将其注册为开机启动，会很方便！ 查看任务管理器看是否有proxy.exe和srvany.exe两个进程，有就成功 现在点击桌面IE右键属性（打开IE—工具—Internet选项）–>连接–> 局域网设置，GAppProxy的默认地址端口为127.0.0.1:8000，如下图：    这样就大功告成啦！ 这个个人服务器每天有1G的流量，对于日常应用浏览网页 是足够的，而且速度很快，跟直接打开网页一样，推荐大 家使用。打开你的Youtube，Twitter，开始冲浪吧！  有什么不懂得可以到这个网去看一下，有各种方案和问题 解答https://groups.google.com/group/gappproxy

最新方法 国内如何注册Google voice

google voice在美国开放注册了，邀请机制彻底退休，那么在中国如何注册google voice呢？




笔者参考了很多文章，但是诸多方法似乎因为年代久远而失效，比如Gizmo5目前就处于不能注册的状态。所以以下是我尝试之后总结的可行方法：




废话少说，先做点准备工作，




首先要注册Nonoh，注册地址http://nonoh.net/en/websignup.php（注册过程省略）；下载nonoh的软件，这是一个网络电话，有一个非常实用的数字键盘，在后面的voice验证环节非常有用。




然后还需要注册IPkall（注册地址http://phone.ipkall.com/），是虚拟的电话号码，可以把上面的nonoh绑定一个美国号码，也是为了通过验证。 按下图注册

然后你会收到邮件，你面有一个号码就是你的绑定号码。




然后登录google voice，但是需要美国IP，可以用VPN，但是笔者发现用GappProxy更加容易，什么？你不知道VPN？也不知道GappProxy？那你是怎么看到我这篇文章的？




GappProxy我会在下篇文章里面说明方法，这里就不详述了。




用GappProxy进入google voice的注册页面，有时候会出现cookie错误，没关系，先正常访问google voice，会出现：

Google Voice is not available in your country.

Thanks for visiting Google Voice. We're not yet open for users outside the US, but are planning to expand our service to additional countries in the future.

这个时候cookie就已经正常创建了，进入注册步骤，选择voice号码（仔细挑选，后面改号码会收$10），第二部pin可以随便写，以后可以更改。

到了第三步，需要绑定号码的时候就用ipkall的给你的号码，然后验证，google会打电话到这个号码，此时因为你绑定了nonoh，所以可以在nonoh里面接听，用nonoh的数字键盘输入两位验证数字：

然后就可以通过验证了。


当然，也许你不喜欢用nonoh，作为Google Fan， 你可以使用Gtalk！
但是gtalk没有数字键盘，所以在验证上有先天的不足，但是你可以用nonoh通过验证之后，再把ipkall给你的号码绑定在gtalk上。就可以用gtalk接电话了。


有两种方法：在Gtalk上把service@gtalk2voip.com加为好友，输入help，会有一个链接，就是你的账户信息页，用上面的信息去绑定ipkall的号码，也可以直接用SIP：你的gtalk用户名，Proxy：gtalk2voip.com，推荐后面一种。


ipkall服务的缺点是每个月必须打通一次电话，否则号码会被回收。


OK，现在你可以用nonoh或者gtalk打电话了，全美电话免费，并且成功注册之后，使用就不在限制在美国ip了。

第五冠

这是一段波澜壮阔的史诗，属于科比的。

　　他带着伤病坚持到底，贡献绝杀，刷新纪录，完成复仇，伟大的一幕不缺乏友谊。当这些关键词聚在一起，就是科比的第五个冠军。

　　复仇 >>他一手抓球，一手指向远方，这一刻属于他，他的快意恩仇。

　　科比说：“这是我迄今为止最美妙的一个总冠军。”

　　湖人和凯尔特人的历史恩怨，只是这场复仇的注脚，2008年6月17日，39分输掉第六场后，科比说：“我们已经做得不错了，但这还不够。”那是一段难堪的岁月，科比完全沉浸在痛苦之中，但他却选择掩饰。奥尼尔幸灾乐祸地出唱片讽刺他，科比轻描淡写地说：“我没把这当回事。”

　　那个时候信他，你就输了。

　　他走出更衣室的同时，也许下承诺，“让我们明年再来”。2009年不属于复仇，尽管科比拿到总冠军，但他的对手换成魔术。可以想象，当科比再一次在总决赛遇见凯尔特人，他远比想象中更加兴奋。科比说：“我没有把这当成是一次成功卫冕，我只是把这当成争夺总冠军。”

　　而在总决赛之前，科比刚刚经历了一次复仇，西部决赛，湖人的对手是太阳，这同样也是一次复仇，科比在2006和2007年都被这个对手挡在第二轮之外。

　　但这样的复仇并不是科比所需要的，奥多姆、拜纳姆就好像打了鸡血一样激动，但科比说：“我不恨太阳，我只是讨厌失败。”过程跌宕起伏，但科比场均33.7分，太阳主教练金特里说：“科比是最好的篮球运动员。”这只是真正复仇之前的开胃菜，科比说：“两年前凯尔特人教会了我们怎么夺冠，现在让他们看看我们成熟了没有。”

　　于是就有了也许是史上最伟大的总决赛七场大战，于是就有了奥尼尔的服软，于是就有了科比灿烂的笑容。他说：“我其实很记仇。”

　　他举起总冠军奖杯，然后又举起总决赛MVP奖杯，漫天飞纸的背后，是凯尔特人落寞的身影。快意恩仇，就是这样。

　　纪录 >>他只比乔丹差一个总冠军，而他正走向第二个三连冠。

　　2010年的总决赛，注定成为科比的一座里程碑。

　　他在总决赛投中的总三分数，超越了乔丹，而他在总决赛的总得分，超越奥尼尔，成为现役第一人，而他的5枚总冠军戒指，只有费舍尔和他共享。而真正完全属于他的纪录，是他在季后赛中拿到5052分，联盟历史上最年轻的季后赛5000分先生。

　　这些纪录见证科比的历史，但并不能描述出一个有血有肉的科比。首轮季后赛还未打完，巴克利说：“科比老了。”然后他很快被扇了一记耳光，科比的爆发将湖人送进第二轮，而年轻的杜兰特则只能等待下次机会。

　　接下来的一切，更像是这一幕的复刻，当湖人从2比1变成2比3，科比的身边从不缺乏恶意的揣摩者，但湖人最终连胜两场，科比在质疑声中走向冠军奖台。“他们都说我老了，而这个冠军，是对他们的最好回敬，”科比说。

　　除了冠军，科比的其他数据更令人吃惊，当大牌球员纷纷放弃最后几场无关大局的比赛，科比站了出来，他说：“我不会因为休息而错过比赛。”进入联盟14个赛季，科比一共打了1021场比赛———是历史上最年轻的1000场先生，最近三个赛季，他只缺席9场比赛。他的出场场次排在历史第88位，但他的出场时间，37366分钟，却排在第38位，季后赛他的场均时间达到40.1分钟。

　　现在，离他32岁生日，只有两个月。

　　在这个赛季之前，他已经实现了NBA球员的大满贯，常规赛、全明星赛、总决赛三项MVP都揽入怀中，得分王、第一阵容也是囊中之物，但他依然表现得就像一个刚进联盟的新人，他在一场比赛中投篮不佳，就会在接下来的训练中加练，甚至不惜为此改变比赛前不投篮的习惯。

　　“每一次我看到他如此努力，我都会和自己说，他的成功是必然的，”科比的队友费舍尔说。

　　创下这些纪录，也是必然的。

　　绝杀 >>一个赛季，3次绝杀，3次准绝杀，他是最值得信赖的人。

　　总决赛最后一场，最后时刻，科比像鹰一样攫住球。这原本像极了想象中的剧本，第七场的最后一秒钟，湖人落后，科比出手，但科比没有，因为他们已然领先4分，总冠军再无悬念。

　　他也不需要用绝杀来证明自己，就在这个赛季，他为湖人贡献了6次制胜一投，其中3次绝杀，而且这还不包括他在赛季初和雷霆的比赛中，最后18秒两罚两中锁定胜局。去年夏天，老K被问及他的美国队到底谁会来执行最后一投，K教练给出答案———科比。

　　几乎是盖棺论定，现役球员中，投最后一球，最值得信赖的，就是科比，哪怕是他的对手也只能服气。

　　2009年12月4日，湖人主场击败热火，赛后，韦德跑到湖人的更衣室，他先和坐在更衣室外的科比妻子瓦妮莎寒暄两句，又抱起科比的女儿，然后他瞪着科比，眼睛中满是愤怒和惊讶。科比耸了耸肩：“嗨，哥们儿，你想要我怎么做？”

　　还剩3.2秒，湖人落后两分，科比面对韦德，在三分线弧顶单脚起跳，球碰到篮板后直接坠入篮圈。“如果赛前有人告诉我，科比能在三分线外踉踉跄跄地起跳，然后球砸到篮板也能进，我肯定以为那个人在说梦话，”韦德说。

　　但不是只有韦德才是牺牲者，12天后，科比又在加时赛中后仰跳投绝杀雄鹿，迈克尔·里德说：“输给科比，尤其是以这种方式，我恨透了。”科比的仇家名单仍在增加，1月1日，新年大战，科比三分绝杀国王；2月1日，科比在还剩7.3秒时投中最后一球，领先凯尔特人1分；2月23日，还剩8.8秒，科比命中三分，客场险胜灰熊；3月9日，科比又让猛龙成为牺牲品。

　　把球交给科比，让他执行最后一投，就这么简单。

　　伤病 >>若不是科比缠着绷带，里弗斯都已经忘了他是带伤作战。

　　科比亮了亮手指，他说：“如果没有绷带，我甚至抓不起篮球。”

　　这是他夺冠之后的感慨，而在此之前，他告诉所有人，手指早已经好了。2009年12月11日，科比带领湖人击败森林狼取得11连胜的同时，也戳伤了他的手指，但他没有接受手术，而是在接下来的20天内，场均轰下34.9分，这其中包括3次40+和两个39分。

　　伤病从不是他的推托之词，尽管他因为脚踝受伤错过全明星，但科比迅速回到球场，他说：“我像羚羊一样能跑能跳。”他的腰也有伤，但科比说没有问题，他的膝盖要在今年夏天抽出积水，但科比说“不会影响比赛”。他购买直升机的惟一原因，是因为他已经难以忍受路途奔波。

　　当总决赛打完第四场，里弗斯恍然大悟般地说：“如果不是科比手指缠着绷带，我都没法想象他还有伤。”这是他的右手食指，是他的投篮指，但绷带从黑色变成白色再变成黑色，科比却从未停止投篮。他用这根受伤的手指，投中一记绝杀，三次准绝杀，但换来的却是巴克利的“我觉得他投中的都是运气球”。

　　科比没有反驳，他的每一次成功，都被认为是理所当然，但他的每一次努力，每一处伤病，都被人抛到九霄云外。

　　科比说：“我只是在和自己作斗争，我想看看，我到底能有多出色。”

　　他从杰里·韦斯特手中接过湖人史上得分王的称号，但他的脚踝按照菲尔·杰克逊的说法，“无法着地，钻心般疼痛”；他追平魔术师约翰逊的5个冠军纪录，但总决赛结束后，他就要进行膝盖手术。

　　哪怕是队友都已经看不过去了，阿泰斯特说：“我觉得他应该休息了。”对胜利的渴望，无法让科比像其他人那样平静，他说：“我只是想赢。无论我做什么，我只是想赢。”

　　所以他赢了，哪怕伤痕累累。

　　友谊 >>科比搂着费舍尔，他的5个总冠军，都有老鱼的身影。

　　走向巅峰的人，未必总是孤独的，比如科比。

　　曾经有一段时间，科比被认为是孤独的，这是因为费舍尔，一个和他同一年进入NBA，而且和他做了11个赛季的队友。费舍尔说：“不管你信不信，我从来没有去过科比的家。”

　　他们就好像是两类人，科比来去匆匆，而费舍尔会留在更衣室接受采访；科比冷酷，言简意赅，而费舍尔和善，接受采访就像聊天般絮絮叨叨；科比是超级巨星，而费舍尔更像是巨星身边的影子。但终究有些镜头令人难忘，科比在去年绝杀热火，跳到他背上的是费舍尔；总决赛第三场费舍尔最后一节爆发，科比握拳仰天长啸，然后又是拥抱；当总决赛结束，科比将总冠军奖杯递给费舍尔，然后他搂着费舍尔，这是他们11年的并肩作战中，第五次手捧总冠军合影。

　　费舍尔是更衣室中，惟一可以批评科比的球员，科比说：“他是我们言语和行动中的领袖。”费舍尔说：“如果你不能赢球，我就不会爱你。”

　　这是科比和费舍尔的择友之道，他们渴望胜利，并且为了这个目的走到一起。费舍尔说：“科比其实挺好相处，而且他还在不断成熟。”

　　他和他的朋友一起拿到总冠军奖杯，而现在他需要去支持他的另一个朋友。庆祝游行结束，科比即将登上前往南非的飞机，那里有刚刚率领阿根廷三战皆胜跻身十六强的梅西———

　　他们是朋友，他们是赢家。

小飞侠科比的经典语录(转载)

身披24号战衣的NBA湖人队球员科比绝对是今年的夺冠大热门，小编整理出他的经典语录，来看看你认同他的行事风格吗？你最喜欢的又是哪一句呢？

“Love me or hate me, it’s one or the other. Always has been. Hate my game, my swagger. Hate my fade away, my hunger. Hate that I’m a veteran. A champion. Hate that. Hate it with all your heart. And hate that I’m loved, for the exact same reasons.”

爱我或者恨我，两者必有其一。一直都这样。有人恨我的比赛，我的狂妄自大；恨我的后仰投篮，我对胜利的渴望；恨我是一名老将，恨我获得过总冠军。恨吧，用你的全部心思去恨吧。然而也有很多人深爱着我，理由却和恨我的人一样。

“It’s funny. I think a lot of people, a lot of writers, try to take shortcuts in their assignments and just regurgitate what somebody else may have written, you know, instead of truly saying what’s going on," Kobe says. "I'm no different than anybody. Basketball to me, it’s a game that I want to try to be the best at, try to work at as much as possible. But I understand it’s a game. But I'm extremely outgoing. People say, 'He's quiet' and all that stuff. That's crazy. They obviously don't know me. So, I mean, people that know me and people that seen me interact, stuff like that, I'm completely opposite of what they read. And a lot of people actually tell me that. They'll say, 'Man, you're nothing like I thought you were.”

“这太有意思了。我想很多人，很多作家，老是想尽办法在他们的写作任务中反复其他人可能已经写过的东西，而不是真实记录正在发生的一些事情。” 科比说，“我跟其他人没什么差别。篮球对于我来说，是一场我要尽可能努力做到最好的比赛。而我理解那是一场比赛。我是很外向的。人们说我很寡言，那简直胡说。他们显然就不了解我嘛。因此，那些了解我，跟我交流的人知道我跟那些报道中的完全不一样。事实上很多人也会这样跟我说，‘你跟我想象中的完全不同。”

"I just go. I just go. I just keep going until it feels right to me," Kobe says of his habits. "If something doesn't feel right, I'm gonna stay there until I get it right. I just continue to keep pushing and pushing and pushing. That’s all I've known. That's how my parents raised me. If you're going to be focused on something, if you want to do something, you can't, you can't go about it in a half-assed way. You really gotta dedicate yourself to it, try to be the best at it. That's the only way."

“我只是不停地训练，不停地训练，直到我满意为止。”科比谈到他的习惯，“如果我感觉一些东西不对，我会呆在那不停地训练，直到我做到对为止。我只是不停地激励自己，不停地激励自己。这是我很了解自己的地方，也是父母教育我的东西。如果你要专注于某些事情，如果你想要做某些事情，你可不能半途而废，你得倾注你全部精力去完成那些事，尽力去完美地完成那些事。这就是事情解决的唯一途径。”

"I'm playing against great players, playing against the best in the world. The competition - that’s what I've always wanted."

“我正在跟伟大的球员进行对抗，跟世界上最好的球员进行对抗。这种对抗是我一直都渴望着的。

"My parents are my backbone. Still are. They're the only group that will support you if you score zero or you score 40."

“父母仍然是我打篮球的支柱。只有他们自始自终在支持你，不管你得到0分，还是砍下40分。”

"I'll do whatever it takes to win games, whether it's sitting on a bench waving a towel, handing a cup of water to a teammate, or hitting the game-winning shot."

“为了取得比赛的胜利，要我做什么都可以，不管是坐在板凳席上给队友递毛巾、递水，还是上场执行致胜一投。”

"As far as carrying the torch for the years to come, I don't know. I just want to be the best basketball player I can be."

“我不知道需要多长时间才能取得辉煌，我只是想尽我所能去成为最出色的篮球运动员。”

"Everything negative - pressure, challenges - is all an opportunity for me to rise."

“压力、挑战，这一切消极的东西都是我能够取得成功的催化剂。”

选自：沪江英语